El origen de Minera Michilla S.A. es la Compañía Minera Carolina de Michilla S.A., constituida en 1959 con el objeto de explotar pertenencias en el Distrito Minero de Michilla, en la Provincia de Antofagasta.
Durante 1980, la propiedad mayoritaria de la compañía fue licitada por la entidad estatal Corporación de Fomento de la Producción (CORFO) y adquirida por el grupo de accionistas que hoy la controla.
En 1989, la empresa participó en la constitución de Compañía Minera Lince Limitada, joint venture con el grupo Outokumpu y Chemical Bank, para desarrollar el proyecto de igual nombre. Dos años más tarde, accionistas vinculados a la propiedad de Carolina de Michilla adquirieron la participación de Chemical Bank y en 1992, también la de Outokumpu.
Tras esta operación, los accionistas de Compañía Minera Carolina de Michilla y Compañía Minera Lince Limitada decidieron la fusión de ambas en Minera Michilla S.A.
Posteriormente, se inició la ampliación de la planta de extracción por solventes y electro obtención con el fin de aumentar la capacidad de producción del complejo minero a 50.000 toneladas anuales de cobre fino en cátodos. En 1994 se puso en marcha la ampliación de la planta de lixiviación en pilas logrando una capacidad de tratamiento de 10.000 toneladas de mineral por día.
La compañía fue transformada en sociedad anónima abierta y registrada en la Bolsa de Comercio de Santiago durante 1995. Dos años después, Michilla se convirtió en la primera empresa minera privada chilena, cuyas marcas de cátodos de cobre (MIC-T y MIC-P) fueron registradas por la Bolsa de Metales de Londres. La compañía superó su capacidad de diseño en 1998, al lograr una producción de 51.121 toneladas de cobre fino.
En 1999, se evaluaron los recursos geológicos de la compañía y las capacidades del proceso productivo de la planta, tras lo cual propusieron ampliaciones y modificaciones con el objeto de tratar un mayor tonelaje de mineral con menores leyes y así mantener los niveles de producción de cobre fino en Planta Cátodos y extender la vida de la compañía. Este proyecto fue aprobado por el directorio en mayo de 2000.
El actual record de producción es de 52.730 toneladas de cobre en el año 2003.
En octubre de 2009, el Directorio de Minera Michilla S.A., aprobó el Plan de Negocio de la compañía para el periodo 2010-2018. Éste contempla la extensión de su plan minero hasta el año 2012 y la realización de estudios e inversiones operacionales que permitirán ampliarlo hasta el año 2018.
La ejecución del plan minero hasta el año 2012, proyectando una producción total de cobre fino de 112 mil toneladas, implicará inversiones operacionales por un monto de US$ 26,5 millones.
A ello se sumarán inversiones por conceptos geológicos, ingenierías y operacionales, por US$ 59,2 millones, destinadas a extender el plan minero hasta el año 2018. Éstas se centrarán en estudios por US$ 8,2 millones para transformar recursos geológicos en reservas mineras rentables y determinar la factibilidad de procesar ripios de lixiviación; e inversiones operacionales por US$ 37,8 millones que permitirán extender el plan minero hasta el año 2015. Paralelamente, se ejecutarán exploraciones geológicas por US$ 13,2 millones durante cuatro años (2010-2013) para la búsqueda de base minera de alto potencial que tiene como objetivo expandir el plan minero hasta el año 2018.